Το Museu Episcopal de Beja στεγάζεται στο Igreja de Nossa Senhora dos Prazeres (Εκκλησία της Παναγίας των απολαύσεων) και λειτουργεί από το 1892. Είναι αγκυροβολημένο στη θρησκευτική αναταραχή που έλαβε χώρα εκείνο τον αιώνα, αφού τα μοναστήρια της Πορτογαλίας καταστάλθηκαν το 1834. Όλα τα λειτουργικά αντικείμενα που διαφορετικά θα είχαν φύγει από την πόλη μεταφέρθηκαν εδώ και παρουσιάστηκαν. Υπάρχουν πίνακες ζωγραφικής, γλυπτά, παραδείγματα χρυσοχοΐας, επιχρυσωμένη σκάλισμα, azulejos και ακόμη και μερικά άμφια.