L'església de Santa Maria di Rivotorto estands a pocs quilòmetres de Santa Maria degli Angeli, i va ser construït en un estil neogòtic seguint el terratrèmol de 1854, en el lloc d'un anterior edifici construït per protegir la "Tugurio francescano" que ara es mantenen a l'interior de l'església. Aquest és el ruïnes d'un lloc on, tradició estats, el Sant i els seus companys es van refugiar a pregar i meditar. A la façana de l'església són les crestes de la Basílica de Sant Francesc (que el santuari depenen) i, per damunt de la porta principal, la frase: "Hic primordia Fratrum Minorum" (Aquí els inicis dels Frares Menors), que recorda la tradició, segons la qual Sant Francesc va elaborar les bases de la Regla Franciscana.
L'interior de l'església té tres naus, separades per columnes poligonals. Aquí trobareu els humils "tugurio di somma umilitate", en el lloc on es va descobrir, el lloc on el sant va refugiar amb Bernardo da Quintavalle i Pietro di Catanio. Està format de tres petites habitacions, la segona de les quals s'utilitza com a capella, amb una del segle xv comunió altar en un octogonal cippus. A l'església, a la contra de la façana, és una pintura de Sant Miquel Arcàngel de Domenico Mattei. A les parets són pintures de Cesare Sermei al·lusió a les Franciscanes de la història.
