ARQUA, iki büyük alanda İspanyol sualtı mirasını keşfetmek için temel bir referanstır. Bunlardan ilki olan "Sualtı Kültürel Mirası", sualtı kazılarında kullanılan metodolojinin açıklanmasına odaklanmaktadır. İki bina, yer seviyesinin altında birbirine bağlanmış ve su altı etkisi yaratacak şekilde tasarlanmış etkileyici modern bir yapıdır. Bu olağanüstü alanın içinde, sualtı arkeolojisinin büyüleyici sürecini açıklayan sergiler ve antik Akdeniz deniz ticaretinde kullanılan tarihi gemilerle ilgili eklektik bir eser koleksiyonu yer almaktadır. İlginç bir özellik de Mazarrón'da bulunan Fenike gemilerinden birinin (MS 7. yüzyıl) replikasıdır. "Mare Hibericum" olarak bilinen diğer alan, ziyaretçileri antik çağlardan 19. yüzyıla kadar Akdeniz'in dinamik ticaret tarihi aracılığıyla İber Yarımadası'nı keşfetmeye davet ediyor. Ayrıca Bajo de la Campana bölgesinde keşfedilen Fenike dönemine ait fil dişleri de bulunmaktadır. İspanya'daki ilk sualtı arkeoloji müzesidir. En iyi özelliklerinden bazıları, gemilerin nasıl inşa edildiğini ve yüklerin nasıl istiflendiğini gösteren yeniden yapılandırılmış gemi kesitleridir. Liman faaliyeti sahnelerini gösteren çok detaylı minyatür dioramalar ve çeşitli dönemlere ait model gemiler bulunmaktadır.
Son sergi, 1804 yılında Portekiz açıklarında batan İspanyol Nuestra Senora de las Mercedes fırkateyni hakkındadır. Enkaz, İspanyol hükümeti ile hazine avcılığı şirketi Odyssy Marine Exploration arasında önemli bir hukuki davaya yol açmış ve müzede sergilenen geleneksel İspanyol sikkeleri de dahil olmak üzere yaklaşık 500 milyon dolar değerinde yağmalanmış eserin İspanya'ya iade edilmesiyle sonuçlanmıştır.
