ARQUA je bitna referenca za otkrivanje španjolske podvodne baštine u dva velika područja. Prvi, "Podvodno kulturno naslijeđe", koji se fokusira na objašnjenje metodologije korištene u podvodnim iskopavanjima.Dvije zgrade za impresivnu modernu strukturu, povezane ispod nivoa zemlje i dizajnirane da stvore podvodni efekat. Unutra, ovaj izvanredan prostor sadrži eksponate koji objašnjavaju fascinantan proces same podvodne arheologije, i eklektičnu kolekciju artefakata koji se odnose na povijesne brodove korištene u drevnoj mediteranskoj pomorskoj trgovini.Zanimljiva karakteristika je replika jednog od feničanskih brodova (7. vek nove ere), pronađena u Mazarronu. Druga oblast, poznata kao "Mare Hibericum", poziva posetioce da otkriju Iberijsko poluostrvo kroz dinamičnu trgovinsku istoriju Mediterana, od antike do 19. veka.Tu su i slonove kljove iz vremena Feničana, otkrivene na lokalitetu Bajo de la Campana. To je prvi podvodni arheološki muzej u Španiji.Neke od najboljih karakteristika su rekonstruirani poprečni presjeci brodova koji pokazuju kako su brodovi konstruirani i kako je teret spremljen. Postoje neke vrlo detaljne minijaturne diorame koje prikazuju prizore lučkih aktivnosti i modele plovila iz različitih epoha.Posljednji prikaz govori o španskoj fregati Nuestra Senora de las Mercedes, koja je potonula kod Portugala 1804. Olupina je izazvala važan pravni spor između španske vlade i kompanije za lov na blago Odyssy Marine Exploration, koji je rezultirao povratom oko 500 miliona dolara vrijednosti opljačkanih artefakata u Španjolsku, uključujući bogatstvo tradicionalnih španjolskih kovanica koje su izložene u muzeju.
