ARQUA je ključna referenca za otkrivanje španjolske podvodne baštine u dva velika područja. Prvi, "Podvodna kulturna baština", koji se fokusira na objašnjenje metodologije koja se koristi u podvodnim iskapanjima.Dvije zgrade za impresivnu modernu strukturu, povezane ispod razine zemlje i dizajnirane za stvaranje podvodnog efekta. Unutra, ovaj izuzetan prostor sadrži eksponate koji objašnjavaju fascinantan proces same podvodne arheologije i eklektičnu zbirku artefakata koji se odnose na povijesne brodove korištene u drevnoj mediteranskoj pomorskoj trgovini.Zanimljivost je replika jednog od feničkih brodova (7. stoljeće nove ere), pronađena u Mazarrónu. Drugo područje, poznato kao "Mare Hibericum", poziva posjetitelje da otkriju Pirenejski poluotok kroz dinamičnu trgovačku povijest Mediterana, od antike do 19. stoljeća.Tu su i slonove kljove iz feničkog doba, otkrivene na nalazištu Bajo de la Campana. To je prvi muzej podvodne arheologije u Španjolskoj.Neke od najboljih značajki su rekonstruirani poprečni presjeci brodova koji pokazuju kako su brodovi bili konstruirani i kako je teret bio smješten. Postoje neke vrlo detaljne minijaturne diorame koje prikazuju scene lučkih aktivnosti i modele plovila iz raznih razdoblja.Posljednji prikaz je o španjolskoj fregati Nuestra Senora de las Mercedes, koja je potonula kod Portugala 1804. Olupina je izazvala važan pravni spor između španjolske vlade i tvrtke za lov na blago Odyssy Marine Exploration, koji je rezultirao povratom oko 500 milijuna dolara opljačkanih artefakata u Španjolsku, uključujući obilje tradicionalnih španjolskih novčića koji su izloženi u muzeju.
