ARQUA je bistvena referenca za odkrivanje španske podvodne dediščine na dveh velikih območjih. Prvo je "podvodna kulturna dediščina", ki se osredotoča na razlago metodologije, uporabljene pri podvodnih izkopavanjih. Dve stavbi za impresivno sodobno strukturo, ki sta povezani pod nivojem tal in zasnovani tako, da ustvarjata podvodni učinek. V notranjosti tega izjemnega prostora so eksponati, ki pojasnjujejo sam fascinanten postopek podvodne arheologije, in eklektična zbirka artefaktov, povezanih z zgodovinskimi ladjami, ki so se uporabljale v starodavni sredozemski pomorski trgovini. Zanimiva je replika ene od feničanskih ladij (7. stoletje našega štetja), ki so jo našli v Mazarronu. Drugo območje, znano kot "Mare Hibericum", obiskovalce vabi k odkrivanju Iberskega polotoka skozi dinamično trgovsko zgodovino Sredozemlja od antike do 19. stoletja. Na najdišču Bajo de la Campana so bili odkriti tudi slonovi okli iz feničanskih časov. To je prvi muzej podvodne arheologije v Španiji. Med najboljšimi znamenitostmi so rekonstruirani prerezi ladij, ki prikazujejo, kako so bila plovila zgrajena in kako so shranjevali tovor. V muzeju je tudi nekaj zelo podrobnih miniaturnih dioram, ki prikazujejo prizore pristaniške dejavnosti, in modeli plovil iz različnih obdobij.
Zadnja razstava govori o španski fregati Nuestra Senora de las Mercedes, ki je leta 1804 potonila ob Portugalski. Razbitje ladje je sprožilo pomemben sodni postopek med špansko vlado in podjetjem Odyssy Marine Exploration, ki je iskalo zaklade, na podlagi katerega so Španiji vrnili za približno 500 milijonov dolarjev izropanih artefaktov, vključno z množico tradicionalnih španskih kovancev, ki so na ogled v muzeju.
