Museum Prasejarah dan Arkeologi Cantabria melestarikan semua artefak dan sisa-sisa yang ditemukan oleh penggalian arkeologi di wilayah tersebut. Oleh karena itu, museum ini memiliki koleksi benda-benda batu dan tulang dari semua gua yang dihias, seperti La Garma, Altamira, El Castillo dan El Pendo.
Museum ini didirikan pada awal abad ke-20 dengan materi yang dikumpulkan terutama oleh J. Carballo. Awalnya terletak di Istana Sobrellano di Comillas, dan secara resmi dibuka oleh Raja Alfonso XIII pada tahun 1926. Koleksinya telah meningkat setiap tahun dengan artefak dari segala usia yang ditemukan oleh penggalian arkeologi di Cantabria. Namun demikian, spesialisasi arkeologi regional di situs Palaeolitik telah menyebabkan periode prasejarah ini diwakili oleh sampel objek yang besar.
Museum ini dibagi menjadi dua bagian: Prasejarah dan Sejarah. Bagian pertama diberikan ruang pameran terbesar. Bagian ini dapat dikunjungi dari sudut pandang yang berbeda: di satu sisi, evolusi dalam perkakas batu dan oleh karena itu budaya material dan proses teknis dapat diapresiasi, sementara di sisi lain, pilihan koleksi utama dari gua-gua di wilayah tersebut, dan periode yang diwakili masing-masing, dapat dipelajari. Yang paling penting adalah Palaeolitikum, tetapi periode prasejarah dan Sejarah kuno lainnya, khususnya Zaman Romawi dan Abad Pertengahan, juga dipamerkan.
