Fort Saint-Jean er en befæstning i Marseille, der blev bygget i 1660 af Ludvig XIV ved indgangen til den gamle havn i Marseille. Fort Saint-Jean-området har været beboet siden antikken, men det var først i det 13. århundrede, at ridderne af Saint-John (senere ridderne af Malta) etablerede sig her og opkaldte området efter dem. Der er stadig nogle levn tilbage. Det store firkantede tårn blev bygget på fundamenterne af Maubert-tårnet for at forsvare havneindgangen efter den aragonske plyndring (1423) af Roy René. Fyrtårnet blev bygget i 1644, og Chevalier de Clerville byggede fortet efter Ludvig XIV's ordre i hans store planer for Marseille. Han fik udgravet et hul, der kunne oversvømmes, for at isolere fortet fra byen. Det blev brugt som garnison og derefter som fængsel under den franske revolution. Under Anden Verdenskrig blev det brugt til at opbevare den tyske hærs ammunition, som eksploderede i 1944 og forårsagede store skader på fortet og transportbroen. Fortet blev opført som Monument Historique i 1964 og optaget i MuCEM i 2013.
