Den befæstede by Šibenik blev grundlagt af kroater omkring det 9. århundrede. På grund af udviklingen af den middelalderlige kroatiske stat byen Šibenik gjort et fremskridt, og det blev nævnt for første gang i 11. århundrede, i et dokument, der er skrevet af kong Petar Krešimir IV. Kort tid efter var der mange forskellige nationer, der kæmper for denne by – fra den Østrigsk-ungarske monarki over Byzans til Venedig, men byen blev stadig gør fremskridt, spredning og udvikle sin kultur, kunst, navigation, handel og økonomi generelt. Šibenik var under Den Venetianske regel i lang 400 år, men fra den periode har vi de mest betydningsfulde historiske og kulturelle steder i Šibenik i dag. Blandt dem er også det vigtigste symbol på byen i dag – katedralen i St. Jacob.
