Rilos vienuolyną X a. įkūrė stačiatikių bažnyčios kanonizuotas šventasis Jonas iš Rilos. Jo asketiška buveinė ir kapas tapo šventa vieta ir virto vienuolyno kompleksu, kuris atliko svarbų vaidmenį viduramžių Bulgarijos dvasiniame ir socialiniame gyvenime.