Bejas reģionālajam muzejam ir vēl viena filiāle šajā senajā baznīcā. Igreja de Santo Amaro faktiski tika dibināta 900. gados, kad Beja bija mauru kontrolē. Un, lai gan tagad tā ir kapela jaunākā baznīcā, kas datēta ar 1500. gadiem,šajā Portugāles nacionālajā piemineklī paliek daudz pirms romānikas mākslas. Tas parāda pirmās hierarhijas pazīmes baznīcā, ar nartheksu nepiederošajiem, nave draudzes locekļiem un kora ekvivalentu, stingri garīdzniekiem. Vienā no kolonnām ir spirālveida kokgriezumi, un galvaspilsētās ir augu un dzīvnieku motīvi, tostarp putnu pāra attēls, kas medī čūsku.
