Il Museo regionale di Beja ha un'altra sede in questa antica chiesa. L'Igreja de Santo Amaro è stata fondata nel 900, quando Beja era sotto il controllo moresco. E mentre ora è una cappella all'interno di una chiesa più recente, risalente al 1500, in questo monumento nazionale portoghese rimane molta arte preromanica. Mostra i primi segni di una gerarchia in una chiesa, con un nartece per gli estranei, la navata centrale per i membri della congregazione e l'equivalente di un coro, rigorosamente per il clero. Una delle colonne ha intagli a spirale, e i capitelli hanno motivi vegetali e animali, tra cui l'immagine di una coppia di uccelli a caccia di serpenti.
