W 1528 roku szkoła zleciła dekorację kopuły Giovanniego Antonio da Pordenone, który ukończył kilka miesięcy później freski przedstawiające:
Przemienienie nad ołtarzem głównym; Bóg Ojciec w chwale w kopule; czterech ewangelistów w piórach; osiem odcinków Starego Testamentu na bębnie; czterech doktorów kościelnych na lunetach. Z tego cyklu fresków pozostało niestety kilka fragmentów. Prezbiterium zostało również przemalowane między 1764 a 1767 przez Giuseppe Angeli, który próbował szanować ikonografię poprzedniego fresku, ale przetłumaczył go jako nieunikniony na język charakterystyczny dla XVIII wieku. Dlatego Przemienienie, Wieczny Ojciec w chwale, ewangelicy i lekarze Kościoła, których widzimy dzisiaj, to dzieło wykonane w XVIII wieku.