Kanisa la Santa Maria di Rivotorto anasimama kilomita chache kutoka Santa Maria degli Angeli, na ilikuwa kujengwa, katika neo-Gothic style kufuatia tetemeko la 1854, kwenye tovuti ya awali ya jengo kujengwa kwa kulinda "Tugurio francescano" ambayo ni sasa naendelea ndani ya kanisa. Hii ni magofu ya mahali ambapo, mila inasema, Saint na wenzake alichukua kimbilio kwa kuomba na kutafakari. Juu ya facade ya kanisa ni crests ya Basilika ya Mtakatifu Francis (ambayo patakatifu wanategemea juu) na, juu ya mlango kuu, maneno: "Hic primordia Fratrum Minorum" (Hapa mwanzo wa Ndugu wadogo), ambayo anakumbuka mila, kulingana na ambayo Saint Francis iliandaa misingi ya Wafransisko Utawala.
Ndani ya kanisa ina aisles tatu, kutengwa na polygonal nguzo. Hapa utapata wanyenyekevu "tugurio di somma umilitate", juu ya tovuti ambapo iligundulika, mahali saint alichukua kimbilio na Bernardo da Quintavalle na Pietro di Catanio. Ni sumu ya tatu ya vyumba ndogo, ya pili ambayo ni kutumika kama kanisa, na kumi na tano karne ya ushirika madhabahu juu ya octagonal cippus. Katika kanisa, juu ya kukabiliana-facade, ni uchoraji wa Saint Michael Malaika mkuu na Domenico Mattei. Juu ya kuta ni uchoraji na Cesare Sermei inataja Wafransisko historia.