Shimabara pilis, yra balta sienelėmis pilis pastatyta ankstyvuoju Edo laikotarpiu kaip vietos feodalo valdovo sėdynės. Pilis buvo ekstravagantiška feodalinės srities puošmena ir buvo kur kas didesnė nei rasta panašaus statuso domenuose. Sunkus apmokestinimas, kuris buvo įvestas mokėti už jo statybą, kartu su vietos krikščionių religiniu persekiojimu, buvo pagrindiniai veiksniai, dėl kurių kilo Šimabaros sukilimas (1637-1638), reikšmingas valstiečių sukilimas.
Shimabarajo galiausiai buvo sunaikintas Meidži laikotarpiu (1868-1912). Dabartiniai pastatai yra betoninės rekonstrukcijos nuo 1964 m. Penkių aukštų pastate yra pilies bokšto muziejus su krikščionių artefaktų kolekcija, iškasta iš pilies griuvėsių, ginklų ir šarvų. 5-ame aukšte esančiame stebėjimo denyje yra vaizdai į Unzen kalną ir per vandenį į Kumamoto aiškiomis dienomis.