Gilios šventumo vieta, kripta buvo pasirinkta Šv. Charles Borromeo kaip asmeninė Maldos vieta, kur jis nuėjo kiekvieną trečiadienį ir penktadienio popietę. Nebuvo neįprasta matyti, kad jis visą naktį praleidžia tai, ką jis pats pavadino "Šventosios Dvasios sporto sale", garbindamas Kristaus kapo simuliakrą. Dėl šios priežasties po jo kanonizacijos buvo pastatyta polichrominė Terakotos statula, vaizduojanti Šventąjį, atsiklaupusį priešais sarkofagą.
Kripta taip pat leidžia lankytojams susisiekti su vienu iš seniausių liudijimų miesto istorijoje. Grindinys, sudarytas iš didelių balto akmens plokščių "Verona", iš tikrųjų kilęs iš ketvirto amžiaus senovės Romos forumo, pagrindinės Romos Civito aikštės, kurioje vyko pagrindinė pilietinė ir religinė veikla, grindinio.
Atnaujinta visuomenei po penkiasdešimties metų 2016 m., vėliau kripta buvo sudėtingos MIBAC finansuojamos restauravimo operacijos objektas ir baigta 2019 m.pavasario pabaigoje, daugiausia skirta dekoruotų paviršių atkūrimui. Dėl restauravimo iš tikrųjų atsirado nuostabių freskų ir dekoracijų, tokių kaip dekoratyvinis ciklas su žvaigždėmis ir augalų elementais presbiterijos skliautuose, datuojamuose iki trylikto amžiaus pabaigos. Buvo atkurtos, taip pat du gražius ir intensyvus crucifixions (vieną ant svarstyklių, išlipti, kiti xiv-ojo amžiaus į presbytery), trys stovi duomenys marija Magdalietė, Jono Krikštytojo ir šv. Helena, motina, Konstantinas (arba galbūt santa Caterina d'alessandria), vakarienė Simono Namai kairiojo sparno presbytery, freskos Madona Loreto ir Madona ir Šventųjų Rocco ir Jono Krikštytojo fojė ir tinkas ir apdaila, xvii amžiuje, apsidė, vaizduojamas su priemonėmis aistra.