Një vend i shenjtë i thellë, dhoma e nëndheshme u zgjodh nga Shën Çarls Boromeo si një vend personal lutjesh, ku ai shkoi çdo të mërkurë dhe të premten pasdite. Nuk ishte e pazakontë ta shihje të kalonte tërë natën në atë që ai vetë e quante "palestra e Shpirtit të Shenjtë," në adhurim të simulakrumit të Varrit Të Krishtit. Për këtë arsye, pas kanonizimit të tij, u vendos një statujë polikrome terrakote që përshkruan Shenjtorin që gjunjëzohej përpara sarkofagut.
Kripta lejon gjithashtu vizitorët të kontaktojnë me një nga dëshmitë më të vjetra në historinë e qytetit. Shtrimi, i përbërë nga pllaka të mëdha të gurit të bardhë 'të Veronës', vjen në fakt nga hapja e Forumit Të lashtë Romak të shekullit të katërt, sheshi kryesor i civitas Romake, ku u bënë veprimtaritë e mëdha civile e fetare.
Rihapur për publikun pas pesëdhjetë vjetësh më 2016, më pas kripti ishte subjekt i një operacioni kompleks restaurimi financuar nga MIBAC dhe përfundoi në fund të pranverës së 2019, që kishte për qëllim kryesisht rimëkëmbjen e sipërfaqeve të dekoruara. Falë restaurimit, në fakt, janë rishfaqur fresko të mrekullueshme dhe dekorime, të tilla si cikli ornamental me yje dhe elementë bimorë në kupolat e presbiterisë, që datojnë në fund të shekullit të tretë. Janë restauruar, gjithashtu dy kryqëzime të bukura e intensive (një në shkallë, zbrit nga shekulli i katërt në presbiteri), tre figura në këmbë të maria Magdalenës, Xhon Pagëzorit dhe shën Helenës, nënës Së Konstandinit (ose ndoshta santa Katerina d'alesandria), darka në shtëpinë E Simonit në krahun e majtë të presbiterisë, freskot e Loretos dhe Madonës Dhe Madonës Në hollin E Shenjtorëve Të shekullit Të shtatë Dhe madonës në dekorimet E shekullit të shtatë të shekullit. përshkruhet me instrumentet e pasionit.