Opatija Hovedøya bila je Cistercijanka koju su 18.maja 1147. osnovali monasi iz Opatije Kirkstead u Engleskoj na ostrvu Hovedøya i posvećena blagoslovljenoj Djevici Mariji i Saint Edmundu. Crkva posvećena Edmundu već je stajala na ostrvu, a monasi su ovo preuzeli kao crkva opatije, mijenjajući je kako bi udovoljili Cistercitskim zahtjevima. Osnivač je Abbot Philippus, na ostrvo je stigao iz Kirksteada u Lincolnshireu u maju 1147.godine, zajedno sa 12 monaha i nekom laičkom braćom. Ostatak samostana slijedi modificirani cistercitski plan gradnje, kako bi se uzelo u obzir malo lokalno brdo. Sama crkva je izgrađena u romaničkom stilu; ostatak manastira je po svoj prilici gotički. Tokom srednjevjekovnog perioda Opatija je bila jedna od najbogatijih institucija u Norveškoj, koja je držala preko 400 nekretnina, uključujući ribarstvo i drvna dvorišta.
Politička previranja tokom sukcesije prijestolja Danska-Norveška dovela su do kraja manastira. Iguman, koji je podržao protestantskog kralja Kristijana II, možda u pokušaju da dobije podršku pred nadolazećom reformacijom, došao je u sukob sa komandantom tvrđave Akershus, Mogenima Gyllenstiernom, koji je ironično podržao rimokatoličkog princa Fridrika I. 1532.godine iguman je bačen u zatvor zbog svojih političkih angažmana, a opat je opljačkan, a zatim postavljen u plamenu, čime je okončan 400 godina monaške aktivnosti u Hovedøyi. Svaka nada koju je red mogao imati u obnovi bogate opatije uništena je 4 godine kasnije, kada je reformacija zahvatila Dansku-Norvešku.