Hara pilis (城城, Harajō) buvo pastatyta 1604 m. ant kalvos su vaizdu į Ariake jūrą. 1637 m. jis tapo galutiniu Shimabara sukilimo mūšio pagrindu, dideliu valstiečių sukilimu - daugelis iš jų buvo krikščionys-kurie buvo nusiminę dėl pernelyg didelio apmokestinimo ir religinio persekiojimo vietos valdovo. Didelės šiogūnato pajėgos buvo išsiųstos sukilimui numalšinti, tačiau gynėjai išsilaikė daugiau nei metus. Galiausiai pilis buvo viršyta, jos Įtvirtinimai sugriauta ir sukilėliai žuvo.
Viskas, kas liko iš Hara pilies šiandien, yra keletas sugriautų įtvirtinimų, įskaitant buvusių baileys kontūrus, akmenines sienas ir pilies vartų pamatinius akmenis. Honmaru (main bailey) dabar yra nedidelis parkas su akmeniniu paminklu, įsimenančiu sukilimą. Taip pat yra bronzinė Amakusa Shiro, charizmatiško jaunojo sukilėlių lyderio, statula, kuri buvo įvykdyta po pilies kritimo.