Dvorac Nijo izgrađen je 1603. godine kao rezidencija u Kyotu Tokugawa Ieyasu, prvom segunu razdoblja Edo (1603-1867). Njegov unuk Iemitsu dovršio je zgrade palače dvorca 23 godine kasnije i dodatno proširio dvorac dodavanjem peterokatnog dvorca.
Nakon pada Tokugawa segunata 1867. godine, dvorac Nijo neko je vrijeme bio korišten kao carska palača, a potom je darovan gradu i otvoren za javnost kao povijesno mjesto. Njegove palače zgrade možda su najbolje očuvane uzorke arhitekture dvorca Japanske feudalne ere, a dvorac je 1994. godine proglašen UNESCO-ve Svjetske baštine.