Die Geschichte der Neptunhöhlen reicht bis in prähistorische Zeiten zurück. Verschiedene Spuren aus der Jungsteinzeit, die in ihnen gefunden wurden, lassen vermuten, dass seit ihrer Entstehung etwa 2.000.000 Jahre vergangen sind. Es ist fast sicher, dass primitive Menschen sie kannten und je nach ihren eigenen Bedürfnissen verwendeten.
Die Neptunhöhlen sind nicht nur die bekanntesten, sondern auch die größten. Sie erstrecken sich über etwa 4 km, aber aus Sicherheitsgründen dürfen Touristen nur einen Teil von ihnen betreten. Die Neptunhöhlen sind nicht nur ein wichtiges Touristenziel, das Besucher aus der ganzen Welt empfängt, sondern auch ein beliebtes Ziel für Höhlenforscher, die als einzige die geheimen Höhlen besuchen können.