Ben Ezra Sunagogi ni kuchukuliwa kuwa kongwe sunagogi katika dunia na pia mrefu kuwahudumia. Sunagogi ina alisimama kwenye tovuti tangu angalau karne ya 9 na aliwahi kuwa mahali pa ibada kwa ajili ya Misri jamii ya Wayahudi mpaka molekuli kuhama kwa Israeli katika miaka ya 1950. Katika historia yake, sunagogi imekuwa upya.
Awali ya ujenzi likapasuka vipande chini karibu 1012 baada ya Fatimid khalifa Al-Hakim bi-Amr Mwenyezi mungu aliagiza uharibifu wa wote wa Kiyahudi na Kikristo maeneo ya ibada. Sinagogi ilikuwa upya kati ya 1025 – 1040 na kisha kabisa upya mara moja zaidi katika miaka ya 1890. Kama karibu wote wa Misri masinagogi, Ben Ezra ni kivutio cha utalii na makumbusho ya leo.