Originea Bazilicii Sfântului Duh începe atunci când imigranții sosiți la sfârșitul secolului al XIX-lea au promovat crearea unei capele dedicate Fecioarei de Guadalupe, patroana Mexicului și a Filipinelor și considerată "împărăteasa Americii". În 1890, o familie pe nume Figueroa a construit o capelă în onoarea lui Guadalupe.
În lipsa unui sediu, monseniorul Aneiros le-a oferit în 1894, Congregației Cuvântului Divin , (fondată astăzi de Sfântul Arnold Janssen la 8 septembrie 1875 în Steyl, un orășel din Olanda, aproape de granița cu Germania) care se afla în țară din 1889, capela pentru a le servi drept sediu.
Acolo, viceparohia Gral. Las Heras (numele parohiei ca jurisdicție civilă) a început să funcționeze la 1 noiembrie 1896. În doar câțiva ani, capela era deja mică pentru cartier. De aceea, au decis să construiască noul templu.
Piatra fundamentală (se află în spatele altarului principal) a fost așezată în 1901 și inaugurată în 1907, din ordinul fondatorului Congregației, noul templu urma să fie dedicat Sfântului Duh.
A fost declarat bazilică la 30 octombrie 1940 de către Papa Pius al XII-lea, "datorită frumuseții și spațialității sale". Imaginea Fecioarei a fost adusă din Mexic.
Bazilica Sfântului Duh are impact în exterior, unde se remarcă cele două turnuri care măsoară 54 de metri înălțime. Cu o ușoară tendință gotică expusă la această înălțime, în fiecare dintre ele se află un ceas impunător, a cărui mașină este de origine germană. Carillonul are trei clopote. Deasupra ceasurilor se află clopotnițele propriu-zise care conțin cinci clopote turnate în orașul Bochum, tot din Germania.