Acvariul Civic este găzduit într-o frumoasă clădire a libertății care, cu frizele și majolica sa, își spune conținutul în exterior. A fost înființată în 1906, ca parte a Expoziției Internaționale de la Milano, și este singurul pavilion construit în Parcul Sempione care nu a fost demontat odată cu încheierea evenimentului. Este al treilea cel mai vechi acvariu din Europa. Acesta este situat lângă Civic Arena și la marginea parcului Sempione, a cărui arhitectură eliptică reproduce.
Structura actuală a clădirii și a băilor este rezultatul renovării (2003-2006) care a readus Institutul, în noua sa formă, vizitatorilor și cetățenilor.