Ніннадзі - один з багатьох великих храмів Кіото, внесених до Списку Всесвітньої спадщини ЮНЕСКО. Це головний храм школи Омуро буддійської секти Шингон, заснований в 888 році правлячим імператором. Протягом багатьох століть один з членів імператорської сім'ї служив головним жерцем Ніннадзі, і храм був також відомий як Імператорський палац Омуро.
Через численні війни і пожежі, які спустошували Кіото протягом всієї його історії, жодна з будівель від заснування храму в 9 столітті досі не збереглося. Найстаріші будівлі датуються початком періоду Едо на початку 1600-х років, включаючи головний зал (Кондо), зал Каннон, парадні ворота Ніомон, внутрішні ворота Чумон і п'ятиповерхову пагоду.