Градският аквариум се намира в красивата сграда liberty, която със своите фризове и майолика разказва за съдържанието си отвън. Тя е създадена през 1906 г.като част от Международна изложба в Милано и е единственият павилион, построен в парка Sempione, който не е демонтиран след приключването на събитието. Това е третият най-стар аквариум в Европа. Той се намира в непосредствена близост до арена civica и на ръба на парка Sempione, който възпроизвежда елиптичната архитектура.
Сегашното завършване на сградата и ваните е резултат от реконструкцията (2003-2006), която върна института, в новото си качество, на посетителите и гражданството.