Αυτή η εντυπωσιακή εκκλησία δεσπόζει πάνω από την Parte Vieja και θεωρείται το παλαιότερο κτίριο του Σαν Σεμπαστιάν. Η προέλευσή της χρονολογείται από τον 12ο αιώνα, αλλά ανοικοδομήθηκε στη σημερινή γοτθική της μορφή στις αρχές της δεκαετίας του 1500. Στο εσωτερικό της υπάρχει μια πολύ ωραία ρωμανική αγιογραφία, έργο των Ambrosio de Bengoechea και Juan de Iriarte. Τα φώτα της δημοσιότητας μοιράζονται το γαλλικό εκκλησιαστικό όργανο του 1868 από τον Cavaille-Coll και τα εντυπωσιακά βιτρό παράθυρα. Στη μία πλευρά της πρόσοψης βρίσκεται το γλυπτό της "Pietà" του καλλιτέχνη Jorge Oteiza. Οι άνθρωποι που βαφτίζονται στο San Vicente είναι γνωστοί ως "koxkeros" για τις πέτρες που προεξέχουν από την εκκλησία (koxka στα βασκικά).
